More slides
authorKai Blin <kai.blin@biotech.uni-tuebingen.de>
Wed, 11 Jan 2012 15:33:57 +0000 (16:33 +0100)
committerKai Blin <kai.blin@biotech.uni-tuebingen.de>
Wed, 11 Jan 2012 15:33:57 +0000 (16:33 +0100)
antismash_lca2011.html
drawings/nrps.odg [new file with mode: 0644]
drawings/server_architecture.odg [new file with mode: 0644]
nrps.svg [new file with mode: 0644]
script.txt
server_architecture_old.png

index 3bb44ff..867a083 100644 (file)
 
   <section class="slide" id="background-nrps">
   <h2>Non-Ribosomal Peptide Synthesis</h2>
+  <img src="nrps.svg">
   </section>
 
   <section class="slide" id="main-talk">
   </ul>
   </section>
 
+
+
   <section class="slide" id="thanks">
   <h1>Thank you</h1>
   </section>
diff --git a/drawings/nrps.odg b/drawings/nrps.odg
new file mode 100644 (file)
index 0000000..9fa0586
Binary files /dev/null and b/drawings/nrps.odg differ
diff --git a/drawings/server_architecture.odg b/drawings/server_architecture.odg
new file mode 100644 (file)
index 0000000..3802953
Binary files /dev/null and b/drawings/server_architecture.odg differ
diff --git a/nrps.svg b/nrps.svg
new file mode 100644 (file)
index 0000000..63d8384
--- /dev/null
+++ b/nrps.svg
@@ -0,0 +1,2 @@
+<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
+<!DOCTYPE svg PUBLIC "-//W3C//DTD SVG 1.1//EN" "http://www.w3.org/Graphics/SVG/1.1/DTD/svg11.dtd"><svg version="1.1" viewBox="0 0 28000 21000" preserveAspectRatio="xMidYMid" fill-rule="evenodd" xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink"><g visibility="visible" id="Default"><desc>Master slide</desc><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="0" y="0" width="28000" height="21000"/></g></g><g visibility="visible" id="page1"><desc>Slide</desc><g><desc>Group</desc><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(255,211,32)"><path d="M 14322,12065 L 1939,12065 1939,3175 26704,3175 26704,12065 14322,12065 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 14322,12065 L 1939,12065 1939,3175 26704,3175 26704,12065 14322,12065"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="1940" y="3175" width="24766" height="8891"/></g><g/></g></g><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(0,0,0)"><path d="M 4664,9379 C 4526,9379 4388,9517 4388,9655 L 4388,10763 C 4388,10901 4526,11040 4664,11040 L 25194,11040 C 25332,11040 25471,10901 25471,10763 L 25471,9655 C 25471,9517 25332,9379 25194,9379 L 4664,9379 Z M 4388,9379 L 4388,9379 Z M 25471,11040 L 25471,11040 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 4664,9379 C 4526,9379 4388,9517 4388,9655 L 4388,10763 C 4388,10901 4526,11040 4664,11040 L 25194,11040 C 25332,11040 25471,10901 25471,10763 L 25471,9655 C 25471,9517 25332,9379 25194,9379 L 4664,9379"/><path style="fill:none" d="M 4388,9379 L 4388,9379"/><path style="fill:none" d="M 25471,11040 L 25471,11040"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="4388" y="9379" width="21083" height="1661"/></g><g/></g></g><g><desc>Group</desc><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(0,0,0)"><path d="M 2570,6520 C 2508,6554 2481,6647 2514,6708 L 4506,10356 C 4540,10417 4634,10446 4695,10413 L 5185,10149 C 5245,10116 5273,10021 5240,9960 L 3248,6312 C 3214,6251 3120,6223 3059,6256 L 2570,6520 Z M 2447,6586 L 2447,6586 Z M 5308,10082 L 5308,10082 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 2570,6520 C 2508,6554 2481,6647 2514,6708 L 4506,10356 C 4540,10417 4634,10446 4695,10413 L 5185,10149 C 5245,10116 5273,10021 5240,9960 L 3248,6312 C 3214,6251 3120,6223 3059,6256 L 2570,6520"/><path style="fill:none" d="M 2447,6586 L 2447,6586"/><path style="fill:none" d="M 5308,10082 L 5308,10082"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="2450" y="6585" width="835" height="4435"/></g><g/></g></g><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(0,0,0)"><path d="M 2702,6399 C 2640,6429 2608,6522 2639,6584 L 2883,7080 C 2913,7142 3006,7174 3068,7144 L 6294,5552 C 6355,5521 6386,5428 6356,5366 L 6112,4870 C 6081,4808 5989,4776 5927,4807 L 2702,6399 Z M 2578,6460 L 2578,6460 Z M 6418,5490 L 6418,5490 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 2702,6399 C 2640,6429 2608,6522 2639,6584 L 2883,7080 C 2913,7142 3006,7174 3068,7144 L 6294,5552 C 6355,5521 6386,5428 6356,5366 L 6112,4870 C 6081,4808 5989,4776 5927,4807 L 2702,6399"/><path style="fill:none" d="M 2578,6460 L 2578,6460"/><path style="fill:none" d="M 6418,5490 L 6418,5490"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="2579" y="6460" width="3874" height="830"/></g><g/></g></g><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(230,230,230)"><path d="M 3141,6607 C 3220,6607 3282,6667 3282,6746 3282,6825 3220,6886 3141,6886 3062,6886 3001,6825 3001,6746 3001,6667 3062,6607 3141,6607 Z M 3001,6607 L 3001,6607 Z M 3283,6887 L 3283,6887 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 3141,6607 C 3220,6607 3282,6667 3282,6746 3282,6825 3220,6886 3141,6886 3062,6886 3001,6825 3001,6746 3001,6667 3062,6607 3141,6607"/><path style="fill:none" d="M 3001,6607 L 3001,6607"/><path style="fill:none" d="M 3283,6887 L 3283,6887"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="3002" y="6608" width="282" height="280"/></g><g/></g></g><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(230,230,230)"><path d="M 4803,9820 C 4881,9820 4941,9880 4941,9959 4941,10038 4881,10099 4803,10099 4725,10099 4666,10038 4666,9959 4666,9880 4725,9820 4803,9820 Z M 4666,9820 L 4666,9820 Z M 4942,10100 L 4942,10100 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 4803,9820 C 4881,9820 4941,9880 4941,9959 4941,10038 4881,10099 4803,10099 4725,10099 4666,10038 4666,9959 4666,9880 4725,9820 4803,9820"/><path style="fill:none" d="M 4666,9820 L 4666,9820"/><path style="fill:none" d="M 4942,10100 L 4942,10100"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="4667" y="9821" width="276" height="280"/></g><g/></g></g><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(0,0,0)"><path d="M 5554,5195 C 5499,5237 5485,5333 5526,5389 L 7181,7608 C 7223,7664 7319,7678 7375,7637 L 7819,7306 C 7874,7265 7889,7167 7848,7112 L 6193,4892 C 6152,4837 6054,4823 5999,4865 L 5554,5195 Z M 5444,5278 L 5444,5278 Z M 7931,7224 L 7931,7224 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 5554,5195 C 5499,5237 5485,5333 5526,5389 L 7181,7608 C 7223,7664 7319,7678 7375,7637 L 7819,7306 C 7874,7265 7889,7167 7848,7112 L 6193,4892 C 6152,4837 6054,4823 5999,4865 L 5554,5195"/><path style="fill:none" d="M 5444,5278 L 5444,5278"/><path style="fill:none" d="M 7931,7224 L 7931,7224"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="5445" y="5277" width="831" height="3046"/></g><g/></g></g><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(230,230,230)"><path d="M 5966,5060 C 6045,5060 6106,5119 6106,5196 6106,5273 6045,5333 5966,5333 5887,5333 5827,5273 5827,5196 5827,5119 5887,5060 5966,5060 Z M 5827,5060 L 5827,5060 Z M 6107,5334 L 6107,5334 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 5966,5060 C 6045,5060 6106,5119 6106,5196 6106,5273 6045,5333 5966,5333 5887,5333 5827,5273 5827,5196 5827,5119 5887,5060 5966,5060"/><path style="fill:none" d="M 5827,5060 L 5827,5060"/><path style="fill:none" d="M 6107,5334 L 6107,5334"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="5828" y="5061" width="280" height="274"/></g><g/></g></g><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:rgb(0,0,0);stroke-width:406;stroke-linejoin:round;fill:none"><path style="fill:none" d="M 8428,8265 C 8428,7852 8348,7440 8267,7441 L 6653,7445 C 6572,7446 6491,7858 6491,8271"/><path style="fill:none" d="M 8428,7440 L 8428,7440"/><path style="fill:none" d="M 6491,8271 L 6491,8271"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="8428" y="7441" width="825" height="1937"/></g><g/></g></g><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(230,230,230)"><path d="M 7405,7106 C 7484,7106 7545,7166 7545,7245 7545,7324 7484,7385 7405,7385 7326,7385 7266,7324 7266,7245 7266,7166 7326,7106 7405,7106 Z M 7266,7106 L 7266,7106 Z M 7546,7386 L 7546,7386 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 7405,7106 C 7484,7106 7545,7166 7545,7245 7545,7324 7484,7385 7405,7385 7326,7385 7266,7324 7266,7245 7266,7166 7326,7106 7405,7106"/><path style="fill:none" d="M 7266,7106 L 7266,7106"/><path style="fill:none" d="M 7546,7386 L 7546,7386"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="7267" y="7107" width="280" height="280"/></g><g/></g></g></g><g><desc>Group</desc><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(0,0,0)"><path d="M 8445,6219 C 8383,6253 8356,6346 8389,6407 L 10381,10055 C 10415,10116 10509,10145 10570,10112 L 11060,9848 C 11120,9815 11148,9720 11115,9659 L 9123,6011 C 9089,5950 8995,5922 8934,5955 L 8445,6219 Z M 8322,6285 L 8322,6285 Z M 11183,9781 L 11183,9781 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 8445,6219 C 8383,6253 8356,6346 8389,6407 L 10381,10055 C 10415,10116 10509,10145 10570,10112 L 11060,9848 C 11120,9815 11148,9720 11115,9659 L 9123,6011 C 9089,5950 8995,5922 8934,5955 L 8445,6219"/><path style="fill:none" d="M 8322,6285 L 8322,6285"/><path style="fill:none" d="M 11183,9781 L 11183,9781"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="8325" y="6284" width="835" height="4435"/></g><g/></g></g><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(0,0,0)"><path d="M 8577,6098 C 8515,6128 8483,6221 8514,6283 L 8758,6779 C 8788,6841 8881,6873 8943,6843 L 12169,5251 C 12230,5220 12261,5127 12231,5065 L 11987,4569 C 11956,4507 11864,4475 11802,4506 L 8577,6098 Z M 8453,6159 L 8453,6159 Z M 12293,5189 L 12293,5189 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 8577,6098 C 8515,6128 8483,6221 8514,6283 L 8758,6779 C 8788,6841 8881,6873 8943,6843 L 12169,5251 C 12230,5220 12261,5127 12231,5065 L 11987,4569 C 11956,4507 11864,4475 11802,4506 L 8577,6098"/><path style="fill:none" d="M 8453,6159 L 8453,6159"/><path style="fill:none" d="M 12293,5189 L 12293,5189"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="8454" y="6159" width="3874" height="830"/></g><g/></g></g><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(230,230,230)"><path d="M 9016,6306 C 9095,6306 9157,6366 9157,6445 9157,6524 9095,6585 9016,6585 8937,6585 8876,6524 8876,6445 8876,6366 8937,6306 9016,6306 Z M 8876,6306 L 8876,6306 Z M 9158,6586 L 9158,6586 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 9016,6306 C 9095,6306 9157,6366 9157,6445 9157,6524 9095,6585 9016,6585 8937,6585 8876,6524 8876,6445 8876,6366 8937,6306 9016,6306"/><path style="fill:none" d="M 8876,6306 L 8876,6306"/><path style="fill:none" d="M 9158,6586 L 9158,6586"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="8877" y="6307" width="282" height="280"/></g><g/></g></g><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(230,230,230)"><path d="M 10678,9519 C 10756,9519 10816,9579 10816,9658 10816,9737 10756,9798 10678,9798 10600,9798 10541,9737 10541,9658 10541,9579 10600,9519 10678,9519 Z M 10541,9519 L 10541,9519 Z M 10817,9799 L 10817,9799 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 10678,9519 C 10756,9519 10816,9579 10816,9658 10816,9737 10756,9798 10678,9798 10600,9798 10541,9737 10541,9658 10541,9579 10600,9519 10678,9519"/><path style="fill:none" d="M 10541,9519 L 10541,9519"/><path style="fill:none" d="M 10817,9799 L 10817,9799"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="10542" y="9520" width="276" height="280"/></g><g/></g></g><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(0,0,0)"><path d="M 11429,4894 C 11374,4936 11360,5032 11401,5088 L 13056,7307 C 13098,7363 13194,7377 13250,7336 L 13694,7005 C 13749,6964 13764,6866 13723,6811 L 12068,4591 C 12027,4536 11929,4522 11874,4564 L 11429,4894 Z M 11319,4977 L 11319,4977 Z M 13806,6923 L 13806,6923 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 11429,4894 C 11374,4936 11360,5032 11401,5088 L 13056,7307 C 13098,7363 13194,7377 13250,7336 L 13694,7005 C 13749,6964 13764,6866 13723,6811 L 12068,4591 C 12027,4536 11929,4522 11874,4564 L 11429,4894"/><path style="fill:none" d="M 11319,4977 L 11319,4977"/><path style="fill:none" d="M 13806,6923 L 13806,6923"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="11320" y="4976" width="831" height="3046"/></g><g/></g></g><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(230,230,230)"><path d="M 11841,4759 C 11920,4759 11981,4818 11981,4895 11981,4972 11920,5032 11841,5032 11762,5032 11702,4972 11702,4895 11702,4818 11762,4759 11841,4759 Z M 11702,4759 L 11702,4759 Z M 11982,5033 L 11982,5033 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 11841,4759 C 11920,4759 11981,4818 11981,4895 11981,4972 11920,5032 11841,5032 11762,5032 11702,4972 11702,4895 11702,4818 11762,4759 11841,4759"/><path style="fill:none" d="M 11702,4759 L 11702,4759"/><path style="fill:none" d="M 11982,5033 L 11982,5033"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="11703" y="4760" width="280" height="274"/></g><g/></g></g><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:rgb(0,0,0);stroke-width:406;stroke-linejoin:round;fill:none"><path style="fill:none" d="M 14303,7964 C 14303,7551 14223,7139 14142,7140 L 12528,7144 C 12447,7145 12366,7557 12366,7970"/><path style="fill:none" d="M 14303,7139 L 14303,7139"/><path style="fill:none" d="M 12366,7970 L 12366,7970"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="14303" y="7140" width="825" height="1937"/></g><g/></g></g><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(230,230,230)"><path d="M 13280,6805 C 13359,6805 13420,6865 13420,6944 13420,7023 13359,7084 13280,7084 13201,7084 13141,7023 13141,6944 13141,6865 13201,6805 13280,6805 Z M 13141,6805 L 13141,6805 Z M 13421,7085 L 13421,7085 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 13280,6805 C 13359,6805 13420,6865 13420,6944 13420,7023 13359,7084 13280,7084 13201,7084 13141,7023 13141,6944 13141,6865 13201,6805 13280,6805"/><path style="fill:none" d="M 13141,6805 L 13141,6805"/><path style="fill:none" d="M 13421,7085 L 13421,7085"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="13142" y="6806" width="280" height="280"/></g><g/></g></g></g><g><desc>Group</desc><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(0,0,0)"><path d="M 14160,6201 C 14098,6235 14071,6328 14104,6389 L 16096,10037 C 16130,10098 16224,10127 16285,10094 L 16775,9830 C 16835,9797 16863,9702 16830,9641 L 14838,5993 C 14804,5932 14710,5904 14649,5937 L 14160,6201 Z M 14037,6267 L 14037,6267 Z M 16898,9763 L 16898,9763 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 14160,6201 C 14098,6235 14071,6328 14104,6389 L 16096,10037 C 16130,10098 16224,10127 16285,10094 L 16775,9830 C 16835,9797 16863,9702 16830,9641 L 14838,5993 C 14804,5932 14710,5904 14649,5937 L 14160,6201"/><path style="fill:none" d="M 14037,6267 L 14037,6267"/><path style="fill:none" d="M 16898,9763 L 16898,9763"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="14040" y="6266" width="835" height="4435"/></g><g/></g></g><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(0,0,0)"><path d="M 14292,6080 C 14230,6110 14198,6203 14229,6265 L 14473,6761 C 14503,6823 14596,6855 14658,6825 L 17884,5233 C 17945,5202 17976,5109 17946,5047 L 17702,4551 C 17671,4489 17579,4457 17517,4488 L 14292,6080 Z M 14168,6141 L 14168,6141 Z M 18008,5171 L 18008,5171 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 14292,6080 C 14230,6110 14198,6203 14229,6265 L 14473,6761 C 14503,6823 14596,6855 14658,6825 L 17884,5233 C 17945,5202 17976,5109 17946,5047 L 17702,4551 C 17671,4489 17579,4457 17517,4488 L 14292,6080"/><path style="fill:none" d="M 14168,6141 L 14168,6141"/><path style="fill:none" d="M 18008,5171 L 18008,5171"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="14169" y="6141" width="3874" height="830"/></g><g/></g></g><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(230,230,230)"><path d="M 14731,6288 C 14810,6288 14872,6348 14872,6427 14872,6506 14810,6567 14731,6567 14652,6567 14591,6506 14591,6427 14591,6348 14652,6288 14731,6288 Z M 14591,6288 L 14591,6288 Z M 14873,6568 L 14873,6568 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 14731,6288 C 14810,6288 14872,6348 14872,6427 14872,6506 14810,6567 14731,6567 14652,6567 14591,6506 14591,6427 14591,6348 14652,6288 14731,6288"/><path style="fill:none" d="M 14591,6288 L 14591,6288"/><path style="fill:none" d="M 14873,6568 L 14873,6568"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="14592" y="6289" width="282" height="280"/></g><g/></g></g><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(230,230,230)"><path d="M 16393,9501 C 16471,9501 16531,9561 16531,9640 16531,9719 16471,9780 16393,9780 16315,9780 16256,9719 16256,9640 16256,9561 16315,9501 16393,9501 Z M 16256,9501 L 16256,9501 Z M 16532,9781 L 16532,9781 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 16393,9501 C 16471,9501 16531,9561 16531,9640 16531,9719 16471,9780 16393,9780 16315,9780 16256,9719 16256,9640 16256,9561 16315,9501 16393,9501"/><path style="fill:none" d="M 16256,9501 L 16256,9501"/><path style="fill:none" d="M 16532,9781 L 16532,9781"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="16257" y="9502" width="276" height="280"/></g><g/></g></g><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(0,0,0)"><path d="M 17144,4876 C 17089,4918 17075,5014 17116,5070 L 18771,7289 C 18813,7345 18909,7359 18965,7318 L 19409,6987 C 19464,6946 19479,6848 19438,6793 L 17783,4573 C 17742,4518 17644,4504 17589,4546 L 17144,4876 Z M 17034,4959 L 17034,4959 Z M 19521,6905 L 19521,6905 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 17144,4876 C 17089,4918 17075,5014 17116,5070 L 18771,7289 C 18813,7345 18909,7359 18965,7318 L 19409,6987 C 19464,6946 19479,6848 19438,6793 L 17783,4573 C 17742,4518 17644,4504 17589,4546 L 17144,4876"/><path style="fill:none" d="M 17034,4959 L 17034,4959"/><path style="fill:none" d="M 19521,6905 L 19521,6905"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="17035" y="4958" width="831" height="3046"/></g><g/></g></g><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(230,230,230)"><path d="M 17556,4741 C 17635,4741 17696,4800 17696,4877 17696,4954 17635,5014 17556,5014 17477,5014 17417,4954 17417,4877 17417,4800 17477,4741 17556,4741 Z M 17417,4741 L 17417,4741 Z M 17697,5015 L 17697,5015 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 17556,4741 C 17635,4741 17696,4800 17696,4877 17696,4954 17635,5014 17556,5014 17477,5014 17417,4954 17417,4877 17417,4800 17477,4741 17556,4741"/><path style="fill:none" d="M 17417,4741 L 17417,4741"/><path style="fill:none" d="M 17697,5015 L 17697,5015"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="17418" y="4742" width="280" height="274"/></g><g/></g></g><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:rgb(0,0,0);stroke-width:406;stroke-linejoin:round;fill:none"><path style="fill:none" d="M 20018,7946 C 20018,7533 19938,7121 19857,7122 L 18243,7126 C 18162,7127 18081,7539 18081,7952"/><path style="fill:none" d="M 20018,7121 L 20018,7121"/><path style="fill:none" d="M 18081,7952 L 18081,7952"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="20018" y="7122" width="825" height="1937"/></g><g/></g></g><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(230,230,230)"><path d="M 18995,6787 C 19074,6787 19135,6847 19135,6926 19135,7005 19074,7066 18995,7066 18916,7066 18856,7005 18856,6926 18856,6847 18916,6787 18995,6787 Z M 18856,6787 L 18856,6787 Z M 19136,7067 L 19136,7067 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 18995,6787 C 19074,6787 19135,6847 19135,6926 19135,7005 19074,7066 18995,7066 18916,7066 18856,7005 18856,6926 18856,6847 18916,6787 18995,6787"/><path style="fill:none" d="M 18856,6787 L 18856,6787"/><path style="fill:none" d="M 19136,7067 L 19136,7067"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="18857" y="6788" width="280" height="280"/></g><g/></g></g></g><g><desc>Group</desc><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(0,0,0)"><path d="M 19875,6201 C 19813,6235 19786,6328 19819,6389 L 21811,10037 C 21845,10098 21939,10127 22000,10094 L 22490,9830 C 22550,9797 22578,9702 22545,9641 L 20553,5993 C 20519,5932 20425,5904 20364,5937 L 19875,6201 Z M 19752,6267 L 19752,6267 Z M 22613,9763 L 22613,9763 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 19875,6201 C 19813,6235 19786,6328 19819,6389 L 21811,10037 C 21845,10098 21939,10127 22000,10094 L 22490,9830 C 22550,9797 22578,9702 22545,9641 L 20553,5993 C 20519,5932 20425,5904 20364,5937 L 19875,6201"/><path style="fill:none" d="M 19752,6267 L 19752,6267"/><path style="fill:none" d="M 22613,9763 L 22613,9763"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="19755" y="6266" width="835" height="4435"/></g><g/></g></g><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(0,0,0)"><path d="M 20007,6080 C 19945,6110 19913,6203 19944,6265 L 20188,6761 C 20218,6823 20311,6855 20373,6825 L 23599,5233 C 23660,5202 23691,5109 23661,5047 L 23417,4551 C 23386,4489 23294,4457 23232,4488 L 20007,6080 Z M 19883,6141 L 19883,6141 Z M 23723,5171 L 23723,5171 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 20007,6080 C 19945,6110 19913,6203 19944,6265 L 20188,6761 C 20218,6823 20311,6855 20373,6825 L 23599,5233 C 23660,5202 23691,5109 23661,5047 L 23417,4551 C 23386,4489 23294,4457 23232,4488 L 20007,6080"/><path style="fill:none" d="M 19883,6141 L 19883,6141"/><path style="fill:none" d="M 23723,5171 L 23723,5171"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="19884" y="6141" width="3874" height="830"/></g><g/></g></g><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(230,230,230)"><path d="M 20446,6288 C 20525,6288 20587,6348 20587,6427 20587,6506 20525,6567 20446,6567 20367,6567 20306,6506 20306,6427 20306,6348 20367,6288 20446,6288 Z M 20306,6288 L 20306,6288 Z M 20588,6568 L 20588,6568 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 20446,6288 C 20525,6288 20587,6348 20587,6427 20587,6506 20525,6567 20446,6567 20367,6567 20306,6506 20306,6427 20306,6348 20367,6288 20446,6288"/><path style="fill:none" d="M 20306,6288 L 20306,6288"/><path style="fill:none" d="M 20588,6568 L 20588,6568"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="20307" y="6289" width="282" height="280"/></g><g/></g></g><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(230,230,230)"><path d="M 22108,9501 C 22186,9501 22246,9561 22246,9640 22246,9719 22186,9780 22108,9780 22030,9780 21971,9719 21971,9640 21971,9561 22030,9501 22108,9501 Z M 21971,9501 L 21971,9501 Z M 22247,9781 L 22247,9781 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 22108,9501 C 22186,9501 22246,9561 22246,9640 22246,9719 22186,9780 22108,9780 22030,9780 21971,9719 21971,9640 21971,9561 22030,9501 22108,9501"/><path style="fill:none" d="M 21971,9501 L 21971,9501"/><path style="fill:none" d="M 22247,9781 L 22247,9781"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="21972" y="9502" width="276" height="280"/></g><g/></g></g><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(0,0,0)"><path d="M 22859,4876 C 22804,4918 22790,5014 22831,5070 L 24486,7289 C 24528,7345 24624,7359 24680,7318 L 25124,6987 C 25179,6946 25194,6848 25153,6793 L 23498,4573 C 23457,4518 23359,4504 23304,4546 L 22859,4876 Z M 22749,4959 L 22749,4959 Z M 25236,6905 L 25236,6905 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 22859,4876 C 22804,4918 22790,5014 22831,5070 L 24486,7289 C 24528,7345 24624,7359 24680,7318 L 25124,6987 C 25179,6946 25194,6848 25153,6793 L 23498,4573 C 23457,4518 23359,4504 23304,4546 L 22859,4876"/><path style="fill:none" d="M 22749,4959 L 22749,4959"/><path style="fill:none" d="M 25236,6905 L 25236,6905"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="22750" y="4958" width="831" height="3046"/></g><g/></g></g><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(230,230,230)"><path d="M 23271,4741 C 23350,4741 23411,4800 23411,4877 23411,4954 23350,5014 23271,5014 23192,5014 23132,4954 23132,4877 23132,4800 23192,4741 23271,4741 Z M 23132,4741 L 23132,4741 Z M 23412,5015 L 23412,5015 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 23271,4741 C 23350,4741 23411,4800 23411,4877 23411,4954 23350,5014 23271,5014 23192,5014 23132,4954 23132,4877 23132,4800 23192,4741 23271,4741"/><path style="fill:none" d="M 23132,4741 L 23132,4741"/><path style="fill:none" d="M 23412,5015 L 23412,5015"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="23133" y="4742" width="280" height="274"/></g><g/></g></g><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:rgb(0,0,0);stroke-width:406;stroke-linejoin:round;fill:none"><path style="fill:none" d="M 25733,7946 C 25733,7533 25653,7121 25572,7122 L 23958,7126 C 23877,7127 23796,7539 23796,7952"/><path style="fill:none" d="M 25733,7121 L 25733,7121"/><path style="fill:none" d="M 23796,7952 L 23796,7952"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="25733" y="7122" width="825" height="1937"/></g><g/></g></g><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(230,230,230)"><path d="M 24710,6787 C 24789,6787 24850,6847 24850,6926 24850,7005 24789,7066 24710,7066 24631,7066 24571,7005 24571,6926 24571,6847 24631,6787 24710,6787 Z M 24571,6787 L 24571,6787 Z M 24851,7067 L 24851,7067 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 24710,6787 C 24789,6787 24850,6847 24850,6926 24850,7005 24789,7066 24710,7066 24631,7066 24571,7005 24571,6926 24571,6847 24631,6787 24710,6787"/><path style="fill:none" d="M 24571,6787 L 24571,6787"/><path style="fill:none" d="M 24851,7067 L 24851,7067"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="24572" y="6788" width="280" height="280"/></g><g/></g></g></g><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(51,204,102)"><path d="M 7474,8060 C 8014,8060 8427,8472 8427,9012 8427,9552 8014,9965 7474,9965 6934,9965 6522,9552 6522,9012 6522,8472 6934,8060 7474,8060 Z M 6522,8060 L 6522,8060 Z M 8428,9966 L 8428,9966 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 7474,8060 C 8014,8060 8427,8472 8427,9012 8427,9552 8014,9965 7474,9965 6934,9965 6522,9552 6522,9012 6522,8472 6934,8060 7474,8060"/><path style="fill:none" d="M 6522,8060 L 6522,8060"/><path style="fill:none" d="M 8428,9966 L 8428,9966"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="6523" y="8061" width="1906" height="1906"/></g><g/></g></g><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(235,97,61)"><path d="M 13335,7620 L 14606,8890 13335,10161 12065,8890 13335,7620 13335,7620 Z M 12065,7620 L 12065,7620 Z M 14606,10161 L 14606,10161 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 13335,7620 L 14606,8890 13335,10161 12065,8890 13335,7620 13335,7620"/><path style="fill:none" d="M 12065,7620 L 12065,7620"/><path style="fill:none" d="M 14606,10161 L 14606,10161"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="12065" y="7620" width="2541" height="2541"/></g><g/></g></g><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(153,204,255)"><path d="M 18588,7945 L 19541,7945 20018,8898 19541,9851 18588,9851 18112,8898 18588,7945 Z M 18112,7945 L 18112,7945 Z M 20018,9851 L 20018,9851 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 18588,7945 L 19541,7945 20018,8898 19541,9851 18588,9851 18112,8898 18588,7945"/><path style="fill:none" d="M 18112,7945 L 18112,7945"/><path style="fill:none" d="M 20018,9851 L 20018,9851"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="18113" y="7946" width="1906" height="1906"/></g><g/></g></g><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(153,51,102)"><path d="M 24144,7949 C 23985,7949 23827,8107 23827,8266 L 23827,9537 C 23827,9696 23985,9855 24144,9855 L 25415,9855 C 25574,9855 25733,9696 25733,9537 L 25733,8266 C 25733,8107 25574,7949 25415,7949 L 24144,7949 Z M 23827,7949 L 23827,7949 Z M 25733,9855 L 25733,9855 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 24144,7949 C 23985,7949 23827,8107 23827,8266 L 23827,9537 C 23827,9696 23985,9855 24144,9855 L 25415,9855 C 25574,9855 25733,9696 25733,9537 L 25733,8266 C 25733,8107 25574,7949 25415,7949 L 24144,7949"/><path style="fill:none" d="M 23827,7949 L 23827,7949"/><path style="fill:none" d="M 25733,9855 L 25733,9855"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="23828" y="7950" width="1906" height="1906"/></g><g/></g></g><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(51,204,102)"><path d="M 13348,10159 C 13888,10159 14301,10571 14301,11111 14301,11651 13888,12064 13348,12064 12808,12064 12396,11651 12396,11111 12396,10571 12808,10159 13348,10159 Z M 12396,10159 L 12396,10159 Z M 14302,12065 L 14302,12065 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 13348,10159 C 13888,10159 14301,10571 14301,11111 14301,11651 13888,12064 13348,12064 12808,12064 12396,11651 12396,11111 12396,10571 12808,10159 13348,10159"/><path style="fill:none" d="M 12396,10159 L 12396,10159"/><path style="fill:none" d="M 14302,12065 L 14302,12065"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="12397" y="10160" width="1906" height="1906"/></g><g/></g></g><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(235,97,61)"><path d="M 19078,9944 L 20349,11214 19078,12485 17808,11214 19078,9944 19078,9944 Z M 17808,9944 L 17808,9944 Z M 20349,12485 L 20349,12485 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 19078,9944 L 20349,11214 19078,12485 17808,11214 19078,9944 19078,9944"/><path style="fill:none" d="M 17808,9944 L 17808,9944"/><path style="fill:none" d="M 20349,12485 L 20349,12485"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="17808" y="9944" width="2541" height="2541"/></g><g/></g></g><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(51,204,102)"><path d="M 19091,12483 C 19631,12483 20044,12895 20044,13435 20044,13975 19631,14388 19091,14388 18551,14388 18139,13975 18139,13435 18139,12895 18551,12483 19091,12483 Z M 18139,12483 L 18139,12483 Z M 20045,14389 L 20045,14389 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 19091,12483 C 19631,12483 20044,12895 20044,13435 20044,13975 19631,14388 19091,14388 18551,14388 18139,13975 18139,13435 18139,12895 18551,12483 19091,12483"/><path style="fill:none" d="M 18139,12483 L 18139,12483"/><path style="fill:none" d="M 20045,14389 L 20045,14389"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="18140" y="12484" width="1906" height="1906"/></g><g/></g></g><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(153,204,255)"><path d="M 24267,9849 L 25220,9849 25697,10802 25220,11755 24267,11755 23791,10802 24267,9849 Z M 23791,9849 L 23791,9849 Z M 25697,11755 L 25697,11755 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 24267,9849 L 25220,9849 25697,10802 25220,11755 24267,11755 23791,10802 24267,9849"/><path style="fill:none" d="M 23791,9849 L 23791,9849"/><path style="fill:none" d="M 25697,11755 L 25697,11755"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="23792" y="9850" width="1906" height="1906"/></g><g/></g></g><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(235,97,61)"><path d="M 24757,11848 L 26028,13118 24757,14389 23487,13118 24757,11848 24757,11848 Z M 23487,11848 L 23487,11848 Z M 26028,14389 L 26028,14389 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 24757,11848 L 26028,13118 24757,14389 23487,13118 24757,11848 24757,11848"/><path style="fill:none" d="M 23487,11848 L 23487,11848"/><path style="fill:none" d="M 26028,14389 L 26028,14389"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="23487" y="11848" width="2541" height="2541"/></g><g/></g></g><g><desc>Drawing</desc><g><g style="stroke:none;fill:rgb(51,204,102)"><path d="M 24770,14387 C 25310,14387 25723,14799 25723,15339 25723,15879 25310,16292 24770,16292 24230,16292 23818,15879 23818,15339 23818,14799 24230,14387 24770,14387 Z M 23818,14387 L 23818,14387 Z M 25724,16293 L 25724,16293 Z"/></g><g style="stroke:rgb(0,0,0);fill:none"><path style="fill:none" d="M 24770,14387 C 25310,14387 25723,14799 25723,15339 25723,15879 25310,16292 24770,16292 24230,16292 23818,15879 23818,15339 23818,14799 24230,14387 24770,14387"/><path style="fill:none" d="M 23818,14387 L 23818,14387"/><path style="fill:none" d="M 25724,16293 L 25724,16293"/></g><g style="stroke:none;fill:none"><rect x="23819" y="14388" width="1906" height="1906"/></g><g/></g></g></g></g></svg>
\ No newline at end of file
index 1f3374c..870dca9 100644 (file)
@@ -220,6 +220,38 @@ For example, I was able to buy this tube of triple-antibiotic ointment at
 Wallmart for less than three dollars. If I misused this, I'd have a good shot
 at creating bacteria resistant to three different antibiotics.
 
+Remember how the central dogma of molecular biology went? From DNA to mRNA to
+protein. Now let me show you one of the exceptions I was talking about earlier.
+Some bacteria and moulds have a completely different way of building proteins.
+There is no blueprint for the product, no mRNA involved and the ribosome never
+sees anything in the process. Instead, the cell builds a huge megaenzyme that
+works just like a factory production line. Many different modules perform a
+well-defined reaction. Then they get the next piece of work where they perform
+the exact same reaction again, rinse, repeat.
 
+So why the heck does the cell bother with a whole new way of producing
+proteins? First of all, compared to the proteins produced by a ribosome, the
+factory-made proteins can contain unusual building blocks. The ribosome is a
+multipurpose machine that can deal with 20 amino acids without requiring any
+changes. A module in the production line megaenzyme is specialized on dealing
+with a single amino acid, but can be designed to deal with non-standard
+amino acids as well.
+
+Also, the production line approach can produce a much higher amount of product
+per timeframe. While the ribosome is building up products at one step at a
+time, the production line performs all the steps at every cycle. So using a
+production line megaenzyme, the cell can pump out a lot of product really fast.
+Because this system allows the cell to build peptides without involving a
+ribosome, this is called non-ribosomal peptide synthesis. The megaenzyme is a
+non-ribosomal peptide synthase, or NRPS in short.
+
+With the biological background part out of the way, let's talk about how I'm
+using antiSMASH to identify gene clusters involved in the production of
+antibiotics. Remember the biology part, I'll be handing out a graded test at
+the end of the talk. Sorry, giving talks in university lecture hall triggers
+teaching reflexes.
+
+antiSMASH, the antibiotics and secondary metabolites analysis shell, is a
+modular pipeline that uses a host of exsiting bioinformatics tools to search
+genomes for secondary metabolite gene clusters.
 
-(Quip about a graded test at the end of the talk)
index 726f914..0ab1c0a 100644 (file)
Binary files a/server_architecture_old.png and b/server_architecture_old.png differ